ان التشخيص الجيني على مستوى خلية يحمل في طياته خصائص دقيقة ومختلفة عن الفحوصات الوراثية الأخرى فحقيقة أن المادة الوراثية التي سيجرى عليها الاختبار هي من أصل خلية أو خليتين، يعني أن المادة الوراثية المراد فحصها قليلة جدا، لذا فهي عرضة إلى خطر التلوث إما بخلايا من الأم أو من